Анализ эффективности алгоритмов ОМК для решения задачи о сворачивании протеинов
Vernadsky National Library of Ukraine
Переглянути архів ІнформаціяПоле | Співвідношення | |
Title |
Анализ эффективности алгоритмов ОМК для решения задачи о сворачивании протеинов
|
|
Description |
Рассматривается гидрофобно-полярная модель сворачивания протеина, предлагается и исследуется алгоритм прогнозирования третичной структуры белка, построенный на базе метода ОМК. Строится модель молекулы протеинов в трехмерной треугольной решетке. Разработаны методы априорной оценки позиции в решетке и обновления матрицы феромонных путей, их эффективность подтверждена вычислительным экспериментом.
Розглядається гідрофобно-полярна модель згортання протеїну, пропонується та досліджується алгоритм прогнозування третинної структури білка, розроблений на базі методу ОМК. Будується модель молекули протеїну в тривимірній трикутній решітці. Запропоновані методи апріорної оцінки позиції в решітці та поновлення матриці феромонних шляхів, їх ефективність підтверджена обчислювальним експериментом. The Hydrophobic-Hydrophilic protein folding model is examined, the algorithm based on ACO optimization method is proposed and analyzed for protein tertiary structure prediction. The molecule model is considered to be a chain whose monomers are placed on the vertices of 3D triangular lattice. The a priori position estimation method and pheromone trails updating method are deviced, computational experiment confirms their appropriateness. |
|
Date |
2015-07-18T12:37:27Z
2015-07-18T12:37:27Z 2012 |
|
Type |
Article
|
|
Identifier |
Анализ эффективности алгоритмов ОМК для решения задачи о сворачивании протеинов / В.А. Рудык // Теорія оптимальних рішень: Зб. наук. пр. — 2012. — № 11. — С. 66-72. — Бібліогр.: 7 назв. — рос.
XXXX-0013 http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/85018 519.21 |
|
Language |
ru
|
|
Relation |
Теорія оптимальних рішень
|
|
Publisher |
Інститут кібернетики ім. В.М. Глушкова НАН України
|
|