Особенности конформационных структур 2'-дезоксиуридина, изолированных в низкотемпературных матрицах Ar и Kr
Vernadsky National Library of Ukraine
Переглянути архів Інформація| Поле | Співвідношення | |
| Title |
Особенности конформационных структур 2'-дезоксиуридина, изолированных в низкотемпературных матрицах Ar и Kr
|
|
| Creator |
Иванов, А.Ю.
|
|
| Subject |
Физические свойства криокристаллов
|
|
| Description |
С помощью низкотемпературной ИК фурье-спектроскопии матричной изоляции и квантово-химических расчетов методами DFT и MP2 исследовано конформационное равновесие молекул нуклеозида 2'-дезоксиуридина (dU) в низкотемпературных матрицах Ar и Kr. Установлено, что в низкотемпературных матрицах доминируют два анти-конформера dU с разными структурами сахарного кольца: С2'-эндо и С3'-эндо. Основной син-конформер стабилизирован внутримолекулярной водородной связью O5'H—O2, а С2'-эндо является доминирующей конформацией его дезоксирибозного кольца в низкотемпературных матрицах Ar и Kr. Продемонстрирована возможность присутствия в матричных образцах минорных син-конформеров без внутримолекулярной водородной связи O5'H—O2. Обнаружено влияние матрицы на ориентацию гидроксильной группы O3'H сахарного кольца основного син-конформера. За допомогою низькотемпературної ІЧ фур’є-спектроскопії матричної ізоляції та квантовох імічних розрахунків методами DFT та MP2 досліджено конформаційну рівновагу молекул нуклеозиду 2'-дезоксиуридину (dU) у низькотемпературних матрицях Ar та Kr. Встановлено, що у низькотемпературних матрицях домінують два анти-конформера dU з різними структурами цукрового кільця: С2'-ендо та С3'-ендо. Основний син-конформер стабілізовано внутрішньо-молекулярним водневим зв’язком O5'H—O2, а С2'-ендо є домінуючою конформацією його дезоксирібозного кільця у низькотемпературних матрицях Ar та Kr. Продемонстровано можливість присутності у матричних зразках мінорних син-конформерів, які не мають внутрішньо-молекулярного водневого зв’язку O5'H—O2. Виявлено вплив матриці на орієнтацію гідроксильної групи O3'H цукрового кільця основного синконформера. The conformational equilibrium of 2'-deoxyuridine (dU) in the low-temperature matrices of Ar and Kr was investigated by using FTIR matrix isolation spectroscopy and quantum chemical calculations with the DFT and MP2 methods. It is found that two anti-conformers of dU with different structures of the sugar ring (С2'-endo and С3'-endo) are dominated. The main syn-conformer is stabilized by the intramolecular hydrogen bond O5'H…O2 and has a С2'-endo conformation of the deoxyribose ring in the inert Ar and Kr matrices. It is demonstrated that in the low-temperature matrices there may occur minor minor syn-conformers without intramolecular hydrogen bond O5'H…O2. The orientation of hydroxyl group O3'H of the sugar ring is found to depend on matrix. |
|
| Date |
2017-05-23T17:10:20Z
2017-05-23T17:10:20Z 2008 |
|
| Type |
Article
|
|
| Identifier |
Особенности конформационных структур 2'-дезоксиуридина, изолированных в низкотемпературных матрицах Ar и Kr
/ А.Ю. Иванов // Физика низких температур. — 2008. — Т. 34, № 9. — С. 962-969. — Бібліогр.: 30 назв. — рос.
0132-6414 PACS : 33.15.–e;67.80.–s http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/117480 |
|
| Language |
ru
|
|
| Relation |
Физика низких температур
|
|
| Publisher |
Фізико-технічний інститут низьких температур ім. Б.І. Вєркіна НАН України
|
|