Спрощена модель селективного фільтру калієвого іонного каналу, що базується на структурних даних
eKMAIR
Переглянути архів Інформація| Поле | Співвідношення | |
| Title |
Спрощена модель селективного фільтру калієвого іонного каналу, що базується на структурних даних
Simplified structure-based model of the potassium channel selectivity |
|
| Creator |
Єсилевський, С.
Харк'янен, В. |
|
| Subject |
вивчення іонних каналів
модель селективного фільтру калієвий іонний канал структурні дані |
|
| Description |
Recent x-ray structures of bacterial Kcsa K+ channel revolutionized the ion channel science. A widely used theoretical model, based on the conception of discrete binding sites in the channel, appears to be inconsistent with the structural data. We developed a model of multiply occupied Kcsa-like selectivity filter based on the best available data. The model explicitly considers ion-ion interactions. Parameters of the ion-ion interactions, such as shielding constant, are determined. The model correctly describes barrierless knock-on conduction in the filter and allows to study the influence of the large-scale filter motions on its properties. It is shown that the concerted motion of multiple ions in the filter may be described as a motion of single "quasi-ion " in the effective energy profile which is easily calculated numerically. Визначення кристалографічної структури бактеріального калієвого каналу Kcsa стало революційним етапом у вивченні іонних каналів. Усталені теоретичні моделі іонних каналів, що базуються на концепції дискретних місць зв 'язування іонів, виявилися несумісними із структурними даними. У даній праці розроблено нову модель Kcsa-подібного селективного фільтра з множинною заселеністю, що базується на найновіших експериментальних даних. У моделі явно розглянуто міжіонні взаємодії та визначено константу екранування поля іонів. Модель правильно описує безбар'єрний виштовхувальний механізм провідності у фільтрі й дає змогу вивчати вплив великомасштабних рухів селективного фільтра на його властивості. Було показано, що провідність здійснюється за рахунок колективних рухів іонів, які можна представити як рух «квазііона» в ефективному потенціалі, який легко піддається моделюванню. |
|
| Date |
2016-03-03T19:54:49Z
2016-03-03T19:54:49Z 2002 |
|
| Type |
Article
|
|
| Identifier |
Yesylevskyi S. O., Kharkyanen V. M. Simplified structure-based model of the potassium channel selectivity filter / S. O. Yesylevskyi, V. M Kharkyanen // Наукові записки НаУКМА. - 2002. - Т. 20: Фізико-математичні науки. - С. 47-53.
http://ekmair.ukma.edu.ua/handle/123456789/8592 |
|
| Language |
en
|
|
| Relation |
Наукові записки НаУКМА: Фізико-математичні науки
|
|