Исследование симметрии генетических текстов методом Фурье-анализа
Vernadsky National Library of Ukraine
Переглянути архів Інформація| Поле | Співвідношення | |
| Title |
Исследование симметрии генетических текстов методом Фурье-анализа
|
|
| Creator |
Волков, В.В.
Леонтьев, А.Ю. |
|
| Description |
В работе предложен метод классификации симметричных структур одноцепочечной ДНК, использующий понятие цветной симметрии. Приводится систематическое перечисление цветных точечных и пространственных групп. Для поиска структур с инверсионной симметрией предлагается использовать фурье-анализ с фильтрацией, основанной на симметричной числовой кодировке нуклеотидной последовательности. Прямые повторы обнаруживаются с помощью фурье-анализа как первого этапа поиска, существенно сокращающего число операций сравнения. Методы опробованы на модельных последовательностях и областях инициации репликации прокариотического генома.
Запропоновано метод класифікації симетричних структур одноланцюгової ДНК, що використовує поняття кольорової симетрії. Наведено систематичне перерахування кольорових точкових і просторових груп. Для пошуку структур з інверсійною симетрією пропонується використовувати фур’є-аналіз з фільтрацією, заснованою на симетричному числовому кодуванні нуклеотидної послідовності. Прямі повтори виявляються за допомогою фур’є-аналізу як першого етапу пошуку, що істотно скорочує число операцій порівняння. Методи апробовано на модельних послідовностях і областях ініціації реплікації прокаріотичного геному. A system of the single strand DNA symmetry based on the theory of coloured symmetry is proposed. The search of the fragments with the inversion symmetry is carried out by means of the Fourier transformation, DNA being preliminary presented as a three-dimensional number series. For the search of the direct repeats the Fourier transformation is proposed as the first step to decrease the number of comparisons. The both methods have been tested on the model sequences as well as on the prokaryotic origins of replication. |
|
| Date |
2019-06-15T08:53:39Z
2019-06-15T08:53:39Z 1990 |
|
| Type |
Article
|
|
| Identifier |
Исследование симметрии генетических текстов методом Фурье-анализа / В.В. Волков, А.Ю. Леонтьев // Биополимеры и клетка. — 1990. — Т. 6, № 6. — С. 68-72. — Бібліогр.: 10 назв. — рос.
0233-7657 DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.0002A3 http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/154144 576.315.42 |
|
| Language |
ru
|
|
| Relation |
Биополимеры и клетка
|
|
| Publisher |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
|
|